Tersedia sistem penerimaan mahasiswa baru dan dilaksanakan secara konsisten sesuai jadwal yang ditetapkan oleh Universitas dan sudah ditetapkan berdasarkan SK Rektor USU No. 701/UN5.1.R/SK/SPB/2013 tentang peraturan akademik dan dokumen manual prosedur tentang penerimaan mahasiswa baru dengan No. MP-GJM-FP-USU-011.

Rekrutmen dan Seleksi Calon Mahasiswa dilakukan secara terpadu ditingkat Universitas. Dokumen manual prosedur untuk masing-masing jalur seleksi penerimaan mahasiswa sudah diatur dan mempunyai buku pedoman. Sampai dengan Tahun 2015 seleksi calon mahasiswa baru Fakultas Pertanian USU dilakukan melalui jalur sebagai berikut :

• Jalur Seleksi Nasional Masuk Perguruan Tinggi Negeri (SNMPTN) USU. Tata cara pendaftaran dilakukan dengan cara USU mengirim formulir ke sekolah-sekolah yang ada di pulau Sumatera dan berkas yang kembali akan diseleksi dan yang masuk kategori dipanggil untuk Registrasi.
• Seleksi Bersama Masuk Perguruan Tingggi Negeri (SBMPTN) USU yang diikuti oleh seluruh Universitas Negeri se Indonesia yang pelaksanaanya juga dilakukan secara serentak di seluruh Indonesia.
• Ujian Masuk Bersama Perguruan Tinggi (UMB) yang dilaksanakan serentak dengan 13 universitas diantaranya Universitas Syiah Kuala, Universitas Negeri Jakarta, Universitas Diponegoro dan Universitas Palangka Raya.
• Seleksi Penerimaan Mahasiswa Program Regular Mandiri. Pelaksanaan seleksi melalui jalur ini dilakukan oleh panitia lokali USU yang waktu ujiannya sudah ditentukan secara terjadwal oleh Universitas

Jumlah Mahasiswa Reguler dan Transfer di Fakultas Pertanian USU Tahun TA 2015/2016

*Dalam penerimaan mahasiswa, Fakultas Pertanian USU sampai saat ini belum ada menerima mahasiswa transfer.